Pirate Warriors est un jeu d'action qui mêle des éléments issus à la fois de la série Dynasty Warriors et de la série One Piece. Le mode histoire du jeu, « Main Log », permet au joueur de suivre le fil de l'intrigue. Le mode Aventure met en scène Luffy dans les événements de la série One Piece, tandis que le mode combat permet au joueur d'utiliser différents personnages lors des affrontements. Dans « Another Log », le joueur peut suivre l'histoire d'un personnage en particulier. Ce mode propose également plusieurs scénarios exclusifs au jeu.